Depuis 2016, MSF s'est associé à une organisation locale, Likhaan, pour offrir des services en santé sexuelle et génésique dans deux districts pauvres et densément peuplés de Manille, Tondo et San Andres.
En 2017, MSF et Likhaan ont déménagé dans une clinique plus grande à Tondo et ont répondu en moyenne à 1'380 consultations par mois réparties entre les deux cliniques. Elles proposent des services de planning familial et de prise en charge des victimes de violence sexuelle, ainsi que le dépistage et traitement du cancer du col de l'utérus.
MSF a aussi collaboré avec Likhaan et Manila City Health pour vacciner plus de 23'000 filles contre le papillomavirus humain responsable du cancer du col de l'utérus.
Plus de 370'000 personnes de la ville de Marawi et de ses environs ont été déplacées par le conflit entre l'armée philippine et le groupe Maute et Abou Sayyaf, deux factions liées à l'État islamique dans la région de Mindanao.
Dès juin 2017, MSF a offert des premiers secours psychologiques à plus de 11'500 personnes, assuré l'assainissement, l'approvisionnement en eau, et des activités d'hygiène, et distribué 1'500 kits d'hygiène et 1'150 jerrycans. Lorsque le siège de Marawi a été levé fin octobre, MSF est resté dans la région pour aider les déplacés internes et les personnes rentrées chez elles.