تعمل طواقم أطباء بلا حدود بالتعاون مع وزارة الصحة وقد دعمت خلال عام 2017 ما يقرب من 11,000 شخص مصاب بفيروس نقص المناعة البشرية. يقدم المشروع خدمات الكشف عن الفيروس وعلاج المرض ومتابعة الحالات، إلى جانب أنشطة التوعية الصحية وذلك في ستة مراكز صحية في العاصمة كوناكري. منذ ديسمبر/كانون الأول 2016 والمنظمة تدعم وحدة بسعة 31 سريراً في مستشفى دونكا الذي يقدم الرعاية الاستشفائية التخصصية للمصابين بالإيدز.

هذا وبدأت المنظمة عام 2017 بأنشطة جديدة في كوروسا الواقعة في شمال شرق غينيا التي تستفحل فيها الملاريا وتمثل السبب الرئيسي للوفيات. يهدف المشروع إلى بناء نماذج للرعاية المجتمعية تستهدف الأطفال دون سن الخامسة بحيث يمكن تعديلها لتناسب المناطق الريفية. وتدعم المنظمة حالياً مستشفى المنطقة وخمسة مراكز صحية. يعمل الفريق على تحسين توفير الرعاية الصحية من خلال التدريب ودعم مزودي الرعاية الصحية المجتمعيين من أجل تشخيص وعلاج الأشكال البسيطة من الأمراض والإصابات كالملاريا والإسهال وسوء التغذية ومن أجل التعرف على الحالات التي تحتاج إلى إحالة.

يتمتع المشروع القائم في غينيا بقدرة كاملة على الاستجابة لحالات الطوارئ كتفشي الأوبئة والكوارث الطبيعية. ففي مارس/آذار 2017 عملت المنظمة مع وزارة الصحة على تنظيم استجابة لوباء حصبة ضرب خمسة أحياء في كوناكري حيث حصنت الطواقم أكثر من 650,000 طفل تتراوح أعمارهم بين ستة أشهر و10 أعوام.